Koerte intellektuaalsetest võimestest on palju vaidlusi. Kuid koera mõte pole veel piisavalt uuritud, et õigustatult seletada oma käitumise teatavaid hetki. Erinevate uuringute ja vaatluste käigus selgus, millised koeratõugud on kõige intelligentsemad, kuidas koerad reageerivad erinevates olukordades, kuidas nad tekitavad refleksid stiimuleid. Kuid tasub kaaluda, et kõige intelligentsemate koerte hinnang sõltub nende võimete kindlaksmääramise kriteeriumidest. Näiteks kui peamine kriteerium on õppimisvõime, siis juhivad tippsildade koerad piirilähedasi koeliaid, mida on lihtne koolitada. Koerad tõusevad Bordercollie'ile, kes suudab töötada nii turvalise koerana kui ka lapsehoidjana. Teine asi selles loetelus on võetud pudeli poolt, millele järgneb saksa lambakoer. Samal ajal on selline nutikad koerad kui Chow Chowil ainult 75. koht, hoolimata asjaolust, et neil koertel on väga arenenud intellektuaalsed võimed. Madal positsioon reitingus on tingitud asjaolust, et chow ei käivita meeskonda, kui ta seda vajalikuks ei pea. Sama kehtib Kaukaasia lambakoerte kohta, kui mõne meeskonna koolitamine isegi ei tööta. Näiteks kaukaasia lambakoer ei kaitse esmaselt ründaja koolitusel kaptenit. Ta mõistab täiesti, et ei ole ohtu, kuid kui ta suudab oma võistlejat üle minna ja ta usub, et rünnak on tõeline, siis on ründaja suur oht, kuna koer käitub sellistes olukordades ettearvamatult. Sama kehtib ka Laikas. Nad tegutsevad olukorra alusel ja võivad olla sõnakuulmatud. Selline käitumine ei viita madalale intelligentsusele. Juba pikka aega olid kärnkonnad põhja karmides tingimustes mehe kaaslased. Näiteks võivad koerad rakmed sujuvalt tugineda suuresti oma koera elegantsile, lõhnale ja kuulmisele, võivad nad peatada või võtta kapteni absoluutselt teises suunas, kui nad tunnevad ohtu, näiteks praod jääs. Seega on nad kujundanud teatud mõistmise suhetest inimesega, pole pimedatele tõugudele omased omadused, kuid nende võimet teha oma otsuseid ja tegutseda vastavalt konkreetse olukorra tingimustele viitab väga kõrgetele intellektuaalsetele võimetele.
Iga koera tõugu kasvatatud või manustatud konkreetsetel eesmärkidel ja seetõttu on raske kindlaks teha, milline tõug on kõige intelligentsem. Näiteks ei saa isegi kõige intelligentsem koer, mis on kaitseks tuletatud, kasulik jahipidamisel, ja koera kaaslane, kes mõistab tema kaptenit poolteist sõnast, teab palju meeskondi, ei saa karja ega ei kaitse territooriumi korralikult. Sellepärast ei ole võimalik kõige intelligentsemat koera tõugu määrata. Samuti pole võimatu kindlaks teha, kes on targem kui kass või koer. Kassid kajastavad keskkonda täiesti erinevalt, mõtlevad teisiti ja tajuvad teavet. Veelgi enam, kass ei tee oma soovile vastupidist, isegi kui ta mõistab, mida sellest vaja on. Nutikas koer ei pruugi ka käske teostada, mida ta ei pea vajalikuks, kuid siiski oma käitumist ja suhtumist
Lisaks konkreetse tõuga kaasasolevatele võimetele sõltub palju haridusest ja pärilikkusest. Isegi kõige intelligentsem koer, kui valesti haritud, võib kaotada oma omadused. Näiteks peetakse Labradori retriiverit tasakaalustatud ja kergesti koolitatud koera, mida kasutatakse pääste- ja politseiteenistuse juhendamiseks. Selliste soodustuste nimekirjaga tegelevad labradorid inimestega seotud rünnakute statistika ühe esimese koha. Seda paradoksi selgitab asjaolu, et tõu kvaliteedi lootuses ei pööranud omanikud haridusele piisavalt tähelepanu, mille tulemuseks olid sõnakuulmatus ja agressioon. Kui enne kutsika omandamist teavad tulevased omanikud täpselt, millised on oma lemmiklooma omadused, kui palju aega nad saavad koolitada, millist kasvatamist ja kasvatamist on koer vaja, siis saavad nad valida sobivat tõugu ja areneda väga intelligentset koera.